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ISSN: 2333-9721
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冰草EST SSR引物和小麦EST SSR引物在黑麦属基因组的通用性分析

DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2014.06.002, PP. 735-739

Keywords: 冰草EST,SSR,小麦EST,SSR,黑麦属,有效扩增,通用性

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Abstract:

为研究黑麦属植物的遗传多样性,开发R基因组特有的分子标记并绘制其遗传连锁图谱,选用1343对冰草ESTSSR引物和786对小麦ESTSSR引物对新疆杂草黑麦和栽培黑麦(共计6份材料)的全基因组进行了PCR扩增,结果显示,有679对冰草ESTSSR引物能够扩出清晰的条带,占引物总数的50.6%;其中有187对引物在6份黑麦材料基因组中扩增产物表现为多态性,占其引物总数的13.9%,平均每对引物扩增条带数为1.1。有364对小麦ESTSSR引物可扩增出清晰的条带,占其引物总数的46.3%;其中有135对引物在6份黑麦材料基因组中扩增产物具有多态性,占其引物总数的17.1%,平均每对引物扩增条带数为2.0。冰草ESTSSR引物在黑麦中的有效扩增效率高于小麦ESTSSR的有效扩增效率,但扩增多态性后者大于前者。两种来源引物扩增强带比率分别为51.8%和32.6%。结果表明小麦和冰草的ESTSSR引物均可用于黑麦基因组分析研究。

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