小麦PM H+ ATPase基因克隆及其推定的蛋白结构分析

为了解小麦PMH+ATPase的基因全序列及其相关生物信息学特征，以豫麦18的基因组DNA为材料，用FullTailPCR方法首次克隆到了小麦PMH+ATPase基因的启动子，并用分段克隆方法克隆了其全长序列（登录号：AY829002）。DNA序列分析结果表明，该基因全长5770bp，含有15个外显子和14个内含子,其中第一个内含子片段较大，长达1432bp。碱基组分分析结果表明，该基因的启动子及5′UTR全长分别为161和201bp，G+C含量分别高达72.1%和72.6%。对其生物信息学特征分析结果表明，该蛋白由951个氨基酸组成，分子量为104.6kD，有44个功能位点，10个跨膜区，1个CationATPase结构域，1个E1E2ATPase结构域和1个水解酶结构域。与其他植物序列比对分析结果表明，不同植物来源PMH+ATPase具有较高的保守性。该基因结构及其推定产物结构的复杂性说明该基因在生命活动调节中的精确性。