一个小麦AP2/ERF转录因子家族单独亚族基因的克隆及分析

AP2/ERF家族转录因子是植物中重要的一类转录因子，广泛参与植物各类生理过程。为了给该家族转录因子的深入研究提供基础，利用小麦EST数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/UGOrg.cgi?TAXID=4565)，以拟南芥AP2/ERF家族转录因子单独亚族成员AtAP2Soloist的氨基酸序列为探针，搜索到一个小麦UniGene数据，经拼接得到1个全长cDNA序列（TaAP2Solosit），通过RTPCR方法从“扬麦15”的cDNA中克隆了该转录因子基因（YM15AP2Solosit）。克隆的转录因子核苷酸序列与电子克隆的序列只有1个碱基不同，两者编码氨基酸序列一致。从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析，结果显示“扬麦15”中的YM15AP2Solosit转录因子属于AP2/ERF家族中的单独亚族，是亲水性蛋白，在蛋白质的三级结构上与拟南芥的AtAP2Soloist相似。EST丰度分析显示，YM15AP2Solosit在根、茎、叶和花中均有表达。