|
麦类作物学报 2006
小麦EST数据批量分析平台的构建与应用DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2006.03.125, PP. 146-151 Keywords: 小麦,EST数据,批量分析,生物信息学,水分胁迫 Abstract: 为进行EST数据批量分析,构建了EST/cDNA序列数据高通量、自动化分析平台。该平台基于Linux操作系统,主要由一些免费软件和perl程序构成.具有自动组装EST序列、查找同源基因、注释基因功能,同时具有进行基因分类等功能。利用该平台对小麦水分胁迫诱导表达的5个cDNA文库的6733条EST序列进行全面分析,初步建立了小麦水分胁迫诱导的基因表达谱。检测结果表明。小麦EST数据批量分析平台为批量EST序列的生物信息学分析提供了实用、便捷工具。
|