二穗短柄草WRKY基因家族成员的鉴定和分析

WRKY转录因子以基因家族形式存在，在植物生长、发育和逆境反应中起着重要作用。二穗短柄草是大麦、小麦和禾本科牧草的模式植物，为了给基因表达和功能鉴定奠定基础，本研究利用生物信息学方法鉴定和分析其WRKY转录因子。结果表明，二穗短柄草有76个WRKY基因，它们具有0~6个内含子，编码区全长396~2847bp，基因分布在5条染色体上；进化分析结果表明，二穗短柄草WRKY在系统发生树上聚为3组，分属于I、II和III类转录因子；核心序列除WRKYGQK外，还有WKKYGQK、WRKYGKK、WRKYGEK、WRKYGQT和WKKYGPK等多种变异类型；锌指模体也存在多种变异，它们是C-X4-C-X21-H-X1-H、C-X3-C-X22-H-X1-H、C-X7-C-X28-H-X1-C、C-X7-C-X24-H-X1-C、C-X7-C-X26-H-X1-C、C-X6-C-X24-H-X1-C、C-X7-C-X33-H-X1-C、C-X6-C-X32-H-X1-C和C-X7-C-X32-H-X1-C。