番茄斑萎病毒属病毒S RNA序列比对

从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间S RNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手，运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析，结果发现，以NSs蛋白序列建立的系统进化树显示CCSV和TZSV之间的同源性为85.8%，IYSV和TYRV之间的同源性达90%，MYSV和PSMV间的同源性为97.5%；通过N蛋白序列分析显示，Tospovirus属中有7组同源性较高的种；在Tospovirus属病毒中非极性氨基酸含量最高，极性酸性氨基酸最少，比较TSWV中抗性破坏RB株系与普通株系在NSs、N核酸、蛋白质序列、氨基酸含量和蛋白质二级结构之间的差异，发现差异不显著．