鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析

从NCBI公共数据库下载获得27 904条鹰嘴豆表达序列标签EST，去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6 198 092 bp的11 224 条无冗余EST．利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR，它们分布于865条EST中，出现频率为8.69%，平均长度为15.58 bp，平均距离为6.31 kb．在鹰嘴豆EST-SSR中，二核苷酸重复是最主要的重复类型(66.90%)，其次是三核苷酸重复类型(30.75%)，出现最多的重复基元类型是TA/AT(24.95%)．