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ISSN: 2333-9721
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辣椒多态性EST?SSR标记开发及连锁图谱构建?

Keywords: 辣椒,多态性,连锁图谱,表达序列标签技术,简单重复序列

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Abstract:

采用SSR检索程序,从辣椒 221 037条unigenes中筛选到17 319个SSR位点,设计了10 468对引物,并对其进行E?PCR多态性检测。结果表明,1 538对引物具有多态性,其中554条辣椒EST序列能匹配到番茄基因组上,构成了12条辣椒EST?SSR连锁群,平均每条连锁群含45.75个EST?SSR。对匹配到番茄基因组上的EST?SSR进行GO(gene ontology)分类,结果有481条EST序列被分类,其中以初生代谢、细胞代谢、生物合成过程为主,分别占34.13%、28.35%、25.82%。在KEGG map中,91条EST序列共涉及到76条代谢途径(KEGG),约67条序列参与新陈代谢途径,32条序列参与次生代谢产物合成途径。

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