基于RNA-Seq技术的毕赤酵母基因组重注释及新型强启动子的发现与序列分析

使用RNA-Seq技术，对毕赤酵母进行了转录组测序。基于测序结果，对现有毕赤酵母基因组进行了重注释，修正了基因组序列中的错误位点861处，发现了新转录本249个及可变剪切现象83个，并更正了553个转录本的错误注释。经过表达谱分析，在毕赤酵母中发现了2个新型强启动子，分别命名为P437和P1431，其驱动的转录本的最高转录水平分别为AOX1基因的1.78倍和3.40倍。序列分析显示，P437和P1431序列中存在着多个酵母转录因子的结合位点。