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ISSN: 2333-9721
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T-RFLP技术在厌氧氨氧化菌群结构分析中的应用

DOI: 10.11918/j.issn.0367-6234.2013.02.005, PP. 26-30

Keywords: 厌氧氨氧化,末端限制性片段长度多态性技术,菌群结构分析,模拟聚合酶链式反应,环境样品

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Abstract:

为实现对样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析,提出一种基于末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)分析环境样品中厌氧氨氧化菌群结构的方法.通过对SILVA(R108)SSURef数据库中已知厌氧氨氧化菌16SrDNA序列的模拟PCR和酶切分析,选取合适的PCR引物(Amx368f-Amx820r)和限制性内切酶(MspI和RsaI),使得不同厌氧氨氧化菌属对应不同末端片段长度(T-RFs),从而完成对厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析.重复性和灵敏性检验结果表明,该方法能够有效、稳定地应用于环境样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析.

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