翘嘴鲌(Culter alburnus)TMEM-57基因的克隆、组织表达和单核苷酸多态性分析

采用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends, RACE)技术首次克隆了翘嘴鲌 TMEM-57蛋白基因的cDNA全序列, 该序列全长为2822bp, 其中5′-UTR区93bp, 3′-UTR区731bp, 开放阅读框(open reading frame, ORF)为1998bp, 编码665个氨基酸。NJ法系统进化分析将同科或属中TMEM-57基因分成一个分支, 表现出种属间的高度保守性。利用荧光定量PCR(qPCR)技术检测了不同组织的表达量, 发现在卵巢中表达量最高, 其次为心脏和脑。用直接测序法对TMEM-57基因部分区段单核苷酸多态性(SNP)进行了检测, 寻找到11个新的SNP位点。