应用高分辨率熔解曲线(HRM)开发大菱鲆(Scophthalmus maximus)SNP标记的研究

利用Vector NTI Advance 11软件分析了NCBI数据库中大菱鲆的12428条EST序列, 筛出候选SNP位点; 应用高分辨率熔解曲线(HRM)对大菱鲆不同性状群体进行基因分型。结果表明, 522个重叠群中共筛出160多个候选SNP位点; 设计56对引物用于实验, 能扩增出目的片段的引物有37条, 合45个位点, 成功率为66.1%; 设计探针, 能与候选SNP位点杂交的探针有13条, 杂交率为28.9%。本实验中能成功进行基因分型的位点共有8个, 占杂交位点的61.5%, 其中有6个为碱基替换型位点, 即G-A和C-T各占3个, 2 个为碱基颠换型位点, 即T-G和A-T各占1个。