深海沉积物中微量DNA的提取及应用

采用化学裂解和酶解相结合的方法, 进行了深海沉积物中微量DNA的提取, 并采用DNA吸附树脂进行纯化。结果表明, 该方法能有效地去除沉积物中的腐殖酸等抑制剂, 每克湿重沉积物样品可得到DNA约16μg, 回收率可达95%, 所得到的DNA分子片段均在23kb左右, 纯化后的DNA可直接应用于各种分子生物学操作。利用细菌16S rDNA通用引物对所提取的深海沉积物DNA进行了PCR-RFLP及系统发育分析, 各主要细菌类群均能检出, 证实该方法可以应用于深海等极端环境中微生物的多样性调查、系统发育分析以及特殊功能基因的筛选, 同时还可应用于环境样品中生物量的半定量估计。