3种水产病原弧菌(Vibrio)的16S—23S rDNA间区(IGSs)的克隆、测序与分析

根据细菌16S rDNA3'端和23S rDNA5'端的高度保守区设计引物，PCR扩增了5株溶藻弧菌、2株河流弧菌和2株创伤弧菌的16S—23S rDNA间区，克隆到pGEM-T载体上，测序;采用BLAST和DNAstar软件对16S—23S rDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析研究。结果表明，3种弧菌共测出的16S—23S rDNA间区有33条，类型有6种：IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSG、IGSA和IGS0，其中IGSIA和IGSG最为常见，9株弧菌均包含有此两类IGS；在3种弧菌中，大部分IGS序列tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性，可以成为设计种特异性引物和探针的靶区。16S—23S rDNA间区结构的差异为建立一类新的弧菌检测方法奠定了基础。溶藻弧菌的16S—23S rDNA间区序列为首次报道。