大菱鲆(Scophthalmus maximus)MHCⅡA基因全长cDNA的克隆与组织表达分析

采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)方法，得到1131bp的大菱鲆MHCⅡA全长cDNA片段。该序列包括720bp的开放阅读框(0RF)，75bp的5′末端非编码区(UTR)以及336bp的3′末端非编码区。利用CLASTAL W1.8软件进行MHCⅡA基因的氨基酸序列比对和同源性比较，结果表明，大菱鲆MHCⅡA与牙鲆MHCⅡA的相似性最高，为69.8%，与真鲷、鲈鱼和丽鱼的相似性次之，分别为65.5%、69.6%和61.4%，与人、鼠和鲨鱼MHCⅡA的相似性仅为19.8%、31.6%和26.9%。应用RT-PCR分析其组织表达发现MHCⅡA基因在正常大菱鲆组织中均表达，但表达量在各个组织中不同，其中在鳃、脾、头肾、心脏、小肠和皮肤中有较强的转录本，中等程度表达于肝和血，在性腺和肌肉中表达最弱。