海洋球石藻(Emiliania huxleyi)病毒硫氧还蛋白(TRX)基因的克隆及生物信息学分析

首次从海洋球石藻病毒(Emiliania huxleyi virus-EhV 99B1)中克隆了硫氧还蛋白(Trx)基因(该序列已提交GenBank, 登录号: GU109280)。系统进化关系分析表明: EhV99B1-Trx 与GenBank 中已报道的EhV86-Trx (NC_007346)有很高的同源性, 核酸及其推导的氨基酸序列的同源性分别为98%和100%, 而与其它物种的Trx 序列同源性仅为9.8%—18.8%。采用生物信息学方法和工具分析了EhV99B1-Trx 的生化参数, 预测了该蛋白的高级结构。结果表明: (1) EhV99B1-Trx 基因的开放阅读框全长591bp, 编码196 个氨基酸, 蛋白的相对分子量为22.1kDa, 理论等电点为5.27; (2) EhV-99B1-Trx N 端蛋白结构域具有保守的Cys-Gly-Pro-Cys (CGPC)硫氧还蛋白氧化还原活性位点氨基酸基序;(3) 对该蛋白二、三级结构分析预测结果进一步证实EhV99B1-Trx 基因编码的为一种新型的硫氧还蛋白家族成员。