中国沿海长蛸(Octopus variabilis)自然群体线粒体COI 基因遗传多样性研究

对我国沿海5 个自然群体长蛸的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)部分序列进行了测定和分析, 经比对获得658bp 核苷酸片段, 其中碱基T、C、A 和G 的平均含量分别为37.02%、18.46%、30.15%和14.35%, AT 的含量明显高于GC 的含量。5 个自然群体的长蛸中共发现18 个变异位点, 得到15 个单倍型, 包括4 个共享单倍型, 其中青岛群体的核苷酸差异数K 以及平均核苷酸多样性指数Pi 最高, 烟台群体最低; 群体间, 青岛群体在群体间核苷酸差异数K、群体间平均每位点核苷酸替代数Dxy 和群体间每位点净核苷酸替代数Da 三个指标上都表现出比其它群体之间较高的水平, 说明青岛群体具有最为丰富的遗传多样性。MEGA 3.1 软件计算5 个群体间的Kimura 2-paramter 遗传距离,大连群体和青岛群体之间的遗传距离最远为0.0077, 而大连群体与烟台群体之间的遗传距离最低,为0.0029。AMOVA 分析表明, 五群体间总遗传分化系数Fst = 0.17410 (P<0.05), 群体间遗传分化远小于群体内。NJ 法和UPGMA 法构建的分子进化树, 5 个地理群体的长蛸聚为两个族群, 大连、烟台群体聚为一族群, 青岛、连云港和舟山群体聚为另一族群。