东海陆架表层沉积物微生物多样性初步研究

从东海陆架DH-13站点的表层沉积物中提取环境基因组DNA, 通过PCR和TA克隆构建了细菌和古菌的16S rDNA基因文库, 并对克隆子文库进行系统发育分析。结果表明: 细菌序列以变形菌门(Proteobacteria, 41.5%)居多, 其次是浮霉菌门(Planctomycetes, 10.9%)、放线菌门(Actinobacteria, 8.9%)和CFB group (7.9%), 另外还有少量酸杆菌门(Acidobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、硝化螺旋菌门(Nitrospira)和厚壁菌门(Firmicutes)等; 古菌序列全部来自泉古生菌门(Crenarchaeota), 其中Marine Crenarchaeotic Group I (MG I, 93.6%)是绝对优势菌, 还有少量序列属于Miscellaneous Crenarchaeotic Group (MCG)、Marine Benthic Group C (MBGC)和Marine Benthic Group A (MBGA)。文库多样性分析结果显示东海陆架表层沉积物中有着丰富多样的微生物群落, 细菌的多样性更为显著。