坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)16S—23S rDNA 间区的克隆及多态性分析

采用16S和23S rDNA保守区设计的引物对两株坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)16S—23S rDNA间区(Intergenic spacer region, ISR)进行了PCR扩增, 并克隆到pMD18-T载体上进行测序; 利用生物信息学进行了16S—23S rDNA间区序列及其内所含tRNA基因的分析。2株坚强芽孢杆菌共得到11条16S—23S rDNA间区特征区带(包括300、400、500和600bp等)序列, ISR 类型包括ISR0、ISRG、ISRIA和ISRGLV四种, 其中ISR0、ISRG和ISRIA可能在坚强芽孢杆菌中普遍存在。相同类型的ISR序列具有较高的相似性(达52.2%—100.0%), 而不同类型的ISR序列间差异较大。此外, ISR 序列在靠近16S和23S区域存在不同长度的保守区域, 可能成为针对坚强芽孢杆菌特异性检测的引物和探针的靶区, 这也为坚强芽孢杆菌新的检测方法的建立奠定了基础。坚强芽孢杆菌的16S—23S rDNA间区序列及其多态性分析均为首次报道。