大黄鱼(Larimichthys crocea)I型干扰素基因的特征与表达分析

采用RT-PCR和RACE-PCR技术克隆了大黄鱼(Larimichthys crocea)I 型干扰素基因全长cDNA序列及其基因组序列, 并利用荧光定量PCR技术研究了该基因在大黄鱼不同组织中的表达谱, 以及副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、LPS、poly I:C刺激后大黄鱼脾脏、肝脏和头肾组织中该基因在转录水平的表达变化。结果表明, 大黄鱼I型IFN基因全长cDNA为878bp, 开放阅读框558bp, 编码185个氨基酸。推测的大黄鱼I型IFN氨基酸序列N端含有20个氨基酸的信号肽, 其后包含一个保守的IFabd结构域。大黄鱼I型IFN基因包含5个外显子, 4 个内含子, 在大多数组织和细胞中都有表达, 其中在血细胞中表达量最高, 肌肉中表达量最低。Poly I:C刺激可诱导大黄鱼I型干扰素基因在脾脏、头肾和肝脏中的表达量显著上调; LPS刺激可诱导大黄鱼I型干扰素基因在脾脏和肝脏中的表达量显著上调; 灭活的副溶血弧菌可诱导大黄鱼I型干扰素基因在头肾和肝脏中的表达量显著上调。