宽体沙鳅(Botia reevesae)β-肌动蛋白基因的cDNA克隆与表达分析

利用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends, RACE)技术首次克隆了宽体沙鳅(Botia reevesae)β-肌动蛋白基因的cDNA全序列, 该序列全长为1795bp, 由长100bp的5'非翻译区(untranslated region, UTR)、570bp的3'非翻译区和1125bp的开放阅读框(open reading frame, ORF)组成, 编码375个氨基酸。宽体沙鳅β-actin氨基酸序列包含1个糖基化位点、9个N-豆寇酰化位点、3个actin信号位点等主要结构区域。PSI-BLAST比对表明, 宽体沙鳅β-actin氨基酸与真鲷、罗非鱼、虹鳟等鱼类同源性达99%。NJ法系统进化分析显示宽体沙鳅β-actin首先与鲢聚在一起, 然后与 鳡、尖头鱥等鱼类聚在一起。荧光定量PCR检测β-actin基因在宽体沙鳅脑、鳃、心脏、肝、胃等12个组织的表达无显著差异(P<0.05), 具有良好的稳定性。