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科学通报 2001
具有抗艾滋病毒活性的多肽T22([T5,12yr,L7yr]-PolyphemusinⅡ)骨架构象模拟, PP. 999-1002 Keywords: T22,([T5,12yr,L7yr]-Polyphemusin,Ⅱ),HIV-1构象,势能面,势能平滑搜索,多构象优化,GB/SA水溶剂模型 Abstract: 用势能平滑搜索方法,在平滑修饰的势能面上对具有抗艾滋病毒HIV-1活性的肽T22([T5,12yr,L7yr]-PolyphemusinⅡ)骨架结构进行了全程搜索,得到该分子骨架结构在修饰势能面上的分子构象全集.用多构象优化方法,选择较适用于肽OPLS力场,采用GB/SA水溶剂模型,优化上述构象集,得到T22骨架结构在水溶液中优势构象集.结果表明势能平滑搜索与多构象优化相结合的构象分析方法是解决含有环结构的柔性分子构象分析中多重最小问题的有效方法.
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