标记与QTL不完全连锁下标记辅助选择的相对效率

模拟研究了闭锁核心群继代选育中标记辅助选择方法的两个实施方案——标记辅助BLUP(MBLUP)和两阶段选择方案,相对于以常规BLUP方法的选择效率,前者同时利用标记信息和表型信息来选择种畜,后者则在两个选择阶段分别利用标记信息和表型信息进行选择.模拟中考虑了不同的遗传力和QTL效应水平.QTL通过侧翼标记识别,且与标记为不完全连锁.研究结果表明,标记辅助选择的两个方案加快了QTL的遗传进展,但降低了多基因效应的进展.当遗传力较低或者QTL效应较大时,MBLUP的遗传进展优于常规BLUP,其优越性可达5%.两阶段选择由于提高了QTL有利基因的频率而大大加快了QTL进展,但总的遗传进展却并无优势.标记辅助选择的相对选择反应与选择世代数密切相关.标记辅助选择的优势或劣势在选择早期较明显,而在随后选择世代中则变小或消失.