粟酒裂殖酵母中3个新的boxH/ACAsnoRNA的鉴定及意义

真核生物rRNA和snRNA中特定位点的假尿嘧啶化修饰是由boxH/ACAsnoRNA指导的,这些RNA通常具有保守的H和ACA元件以及“发夹-铰链-发夹-尾”的二级结构.通过筛选cDNA文库,从粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe)中鉴定了3个新的boxH/ACAsnoRNA,分别命名为SP12,SP16和SP20.这些小分子RNA3′末端都具有ACA类元件,其二级结构中包含2或3个较大的类似发夹的结构.尽管SP20的H元件并不典型,但能折叠成典型boxH/ACAsnoRNA的二级结构,推测其具有指导18SrRNA上U1208和U1053两个位点的假尿嘧啶化修饰的功能.相反,SP12和SP16的二级结构不同于SP20,并且也没有与rRNA或snRNA互补的反义元件,所以被称为“功能未知的向导snoRNA(orphanguideRNA”,其功能尚有待阐明.SP12和SP16的基因都位于2个编码蛋白质基因的间隔区,SP16snoRNA是从一个较大的RNA前体剪切加工而来.有趣的是,SP20基因位于一个预测的蛋白质基因的编码区中,但转录方向相反.Northern杂交和RT-PCR分析都无法检测到该蛋白质基因的mRNA,表明该基因在细胞中的表达是不存在的.这是粟酒裂殖酵母中一个推测编码蛋白质的基因位点反向编码一个小分子RNA的首次报道.