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ISSN: 2333-9721
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科学通报  2008 

分子对接结合比较分子相似性指数分析用于雌激素类化合物活性预测和分子机理研究

, PP. 2735-2741

Keywords: 雌激素类化合物,受体结构,分子对接,比较分子相似性指数分析(COMSIA),定量结构与活性相关(QSAR)

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Abstract:

雌激素类化合物通过干扰人和野生动物正常内分泌的功能,对人和野生动物的健康产生严重的负面影响.对雌激素类化合物雌激素活性的分子机理和活性预测一直受到广泛的关注.以44个结构差异较大的化合物为研究对象,发展了基于雌激素受体(α亚型)结构的比较分子相似性指数分析方法(COMSIA),研究雌激素类化合物结构与活性的关系,对雌激素化合物活性进行预测,建立了相关性显著、预测能力强的定量模型(R2=0.965,Q2LOO=0.599,R2pred=0.825).并且阐明了影响化合物雌激素活性的分子结构特征,揭示了受体结合腔中起关键作用的氨基酸残基以及这些氨基酸残基与配体化合物作用的具体方式.

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