从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族
, PP. 591-595
Keywords: 蛋白质酪氨酸磷酸酶,序列模体,超家族的序列识别,假定蛋白质,分子进化
Abstract:
以进化上相距较远的蛋白质酪氨酸磷酸酶Ⅰ和Ⅱ为例,通过结构比较和基于结构的序列比对及共同保守区域残基替换模式的分析,定义了基于结构的序列模体.利用这种新的模体对SWISS-PROT和TrEMBL蛋白质序列库进行搜索,可特异性地同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ,其识别正确率可达98.4%.而在此之前,尚未见可同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ序列模体的报道.
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