水稻穗部突变体Cl的形态和定位分析

簇生穗突变体Cl表型为多数枝梗顶端有2或3个小穗簇生在一起.利用扫描电子显微镜观察显示,Cl的功能与水稻枝梗顶部的发育有关,同时Cl影响了顶端小穗的伸长;而Cl突变体中穗粒数有一定降低,提示Cl基因可能对水稻穗粒数也有一定的影响.分别利用Cl与中花11及Cl与浙辐802杂交的F2群体对Cl位点进行遗传定位,Cl位点初步定位在第6染色体的CAPS标记CK0214和SS0324之间.为了进一步精细定位Cl位点,在CK0214和SS0324之间发展了5个CAPS标记,连锁分析表明,Cl与其中2个标记R0674E和C12560紧密连锁,遗传距离分别为0.2和2.1cM,并且Cl被定位在这两个标记之间.以此为起点,构建覆盖Cl基因区域的PAC重叠群,两个PAC克隆AP004571和AP004236将Cl位点覆盖,物理距离为196kb,为最终克隆Cl基因奠定了基础.等位性测定显示,Cl与另一个水稻簇生穗突变体Cl2是等位突变.