用于SARS冠状病毒检测的60mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用

设计并应用60mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测.根据寡核苷酸基因芯片的原则设计出30条60mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以最先提交全序列的TOR2株作为参考,GenBank登录号AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,从临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描.初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的可行性.杂交结果表明,来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与3个SARS探针有杂交.由此可知,采用60mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况.