基于密码子使用特征预测家族性扩张型心肌病的疾病基因

家族性扩张型心肌病(FDC)是一种以常染色体显性遗传为主的单基因病,迄今已定位了15个常染色体显性遗传FDC的疾病基因区间,但只确定了其中8个定位区间的致病基因,另外7个定位区间中的FDC疾病基因仍有待发现.本文对已知的FDC疾病基因序列进行了深入分析,发现其密码子使用频率分布具有显著的特异性,并设计了基于这种特征预测FDC疾病基因的新方法.交叉验证结果表明,该方法能够从定位区间内众多的基因中有效预测出FDC疾病基因.除具有较高的预测精度外,该方法的另一显著优点是只需要知道基因序列数据,因而有可能帮助发现那些功能还完全未知的FDC疾病基因.在此基础上,用该方法对疾病基因还未知的7个FDC定位区间进行了分析,给出了FDC疾病基因的预测结果和预测软件(http//infosci.hust.edu.cn),可为相关实验研究发现新的FDC疾病基因提供帮助.