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科学通报 2006
氨基酸广义疏水标度(GH-scale)用于HLA-A*0201限制性CTL表位的定量预测研究, PP. 1259-1263 Keywords: 氨基酸广义疏水标度,HLA-A*0201,CTL表位,定量构效关系,遗传-偏最小二乘回归 Abstract: 将天然氨基酸149个疏水性质经主成分分析得到了一种新氨基酸描述子——氨基酸广义疏水标度(GH-scale).用GH-scale结合遗传偏最小二乘(GPLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行定量构效关系(QSAR)研究.所建模型拟合及交叉检验复相关系数分别为和Q2=0.725.研究表明,疏水作用在CTL表位与HLA-A*0201结合过程中扮演极其重要角色,而锚定残基是该类作用发生最显著的部位.
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