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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用：99美元
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水稻功能基因组育种数据库(RFGB):3K水稻SNP与InDel子数据库
DOI: 10.1360/N972014-01231, PP. 367-371
郑天清, 余泓, 张洪亮, 吴志超, 王文生, 太帅帅, 迟璐, 阮珏, 韦朝春, 石建新, 高用明, 傅彬英, 周永力, 赵秀琴, 张帆, McNALLY, Kenneth, L., 李自超, 张耕耘, 李家洋, 张大兵, 徐建龙, 黎志康
Keywords: 3K水稻,单核苷酸多态性,插入缺失,基因组育种,数据库
Abstract:
水稻是全世界最重要的粮食作物之一.对全球水稻品种资源进行基因组研究,挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义,是关系着国家乃至全球粮食安全的重大战略问题.本研究通过全球3000份水稻资源(3K水稻)的全基因组重测序,获取了其中质量较好的2859份水稻基因组的单核苷酸多态性(SNP)及小片段插入缺失(InDel)的基因组变异数据,建立了综合性的水稻功能基因组育种数据库的SNP与InDel多态性子数据库.该子数据库包含了3K水稻多态性信息检索、基因组浏览器可视化系统、特定正段基因组数据导出系统等多项功能.本数据库的建立将为研究水稻基因功能、指导水稻全基因组选择育种提供重要平台.
| [1] | 1 Matsumoto T, Wu J Z, Kanamori H, et al. Nature, 2005, 436: 793-800
|
| [2] | 2 Huang X, Kurata N, Wei X, et al. Nature, 2012, 490: 497-501
|
| [3] | 4 Li J Y, Wang J, Zeigler R S. GigaScience, 2014, 3: 8
|
| [4] | 5 Barreiro L B, Laval G, Quach H, et al. Nat Genetics, 2008, 40: 340-345
|
| [5] | 3 The 3000 rice genomes project. GigaScience, 2014, 3: 7
|
| [6] | 6 DePristo M A, Banks E, Poplin R, et al. Nat Genetics, 2011, 43: 491-498
|
| [7] | 7 Kawahara Y, de la Bastide M, Hamilton J P, et al. Rice (N Y), 2013, 6: 4
|
| [8] | 8 Skinner M E, Uzilov A V, Stein L D, et al. Genome Res, 2009, 19: 1630-1638
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