基于内含子和外显子的系统发育分析的比较

在灵长目动物中分离出7个断裂基因的内含子和外显子序列,分别进行系统发育分析.比较结果显示(1)基于内含子与基于外显子所得到的进化树的拓扑结构基本一致,但由于内含子和外显子序列的突变速率不同,导致进化树的分枝长度不同;(2)在hominoids中,外显子的替代速率下降,而内含子的替代速率相对稳定;(3)当选用cebus作为参考物种时,基于不同外显子推测出的orangutan的分歧时间相差较大,而基于不同内含子序列所得的分歧时间比较接近,且与化石记录相吻合,这说明内含子序列可作为一个更好的“分子钟”;(4)对于不同基因,序列的G+C含量与它的替代速率有一定关系,当内含子的替代速率大于相应的外显子时,内含子的G+C含量较低.所有这些结果显示,内含子序列可以用来在近亲缘关系的物种中进行进化分析.