棉纤维次生壁加厚期cDNA-AFLP表达谱剖析和转录组图谱构建

棉纤维强度主要由棉纤维次生壁加厚期决定.以陆地棉品种中棉所8号和海岛棉品种Pima90-53建立的包含109个单株的种间杂交F2群体为材料,用cDNA-AFLP对棉纤维发育次生壁加厚期(20~25DPA)基因表达谱进行剖析,并构建了次生壁加厚期转录组图谱.37对AFLP引物组合共检测到138个多态性表达片段(transcript-derivedfragments,TDFs),大小在100~722bp之间,其中75个TDFs(53.62%)在亲本和F2单株中均具有多态性.在75个TDFs中,37个和已发表的棉纤维EST同源性较高;9个和已克隆的棉纤维基因,如半胱氨酸蛋白激酶、液泡H+-焦磷酸激酶、液泡H+-ATP催化亚基、半乳糖蛋白、受体蛋白激酶、GIA/RGA-赤霉素应答元件和纤维素合成酶等的编码基因同源性高;其他TDFs可能代表棉纤维发育过程中的新基因片段.在75个TDFs中,有46个集中分布在一个连锁群上.