棉花耐涝相关种质资源遗传多样性分析

为了解棉花耐涝相关种质资源的遗传多样性，选用均匀分布于棉花全基因组的145对引物，从中筛选出44对SSR引物对48份涝相关种质资源进行遗传多样性分析。结果表明，44对SSR引物在48份材料中共检测出170个等位基因变异,平均每个位点有386个。其中耐涝材料的位点多态信息含量(PIC)、每个位点的有效等位基因数(Ne)、基因型多样性(H′)分别为0632、17104和03937,涝敏感材料的PIC、Ne、H′分别为0628、17216和03994。耐涝材料和涝敏感材料的Jaccard相似性系数分别在0462~0925和0398~0845之间,遗传相似性系数总体平均值接近,但耐涝材料的变化幅度更大。用类平均法(UPGMA)聚类将48份材料分成2个类群。其中，第Ⅰ类包含39个品种，第Ⅱ类包含9个品种。大多数材料之间的遗传相似性系数较高,表明陆地棉耐涝相关种质资源遗传基础狭窄。本结果可为棉花耐涝育种亲本选配和相关机理研究提供基础资料