中华卵索线虫线粒体基因组多态性分析

为完善昆虫病原索科线虫线粒体基因组全序列数据库,更系统地研究其基因组特征和系统演化规律,进而为发挥该线虫生防潜力打下基础,我们开展了中华卵索线虫Ovomermissinensis线粒体全基因组的研究。该研究通过线粒体基因组滚环复制及酶切图谱,揭示了中华卵索线虫线粒体基因组具有种内遗传多态性,即群体中单体线虫具有独特的酶切条带,且条带累加之和变化范围较大,为16.5～24.5kb。为进一步了解线粒体基因组多态性特征及产生的分子机制,采用两步长PCR方法对2条代表性成虫线粒体基因组进行了测序及拼接,得其全长分别为18864和16777bp。对这2条序列的比对表明,线粒体基因组中位于ND2和ND4之间的可变区域,不仅基因排列顺序不同,且存在ND3基因重复现象,这是导致中华卵索线虫线粒体基因组呈现多态性的主要原因。通过对以上研究结果的分析及与GenBank中已有的6种索科线虫线粒体基因组序列进行比对,概括出其线粒体基因组基本特点:①线粒体基因排列顺序各不相同；②部分线虫线粒体基因存在重复现象,且重复次数不同；③线粒体基因组大小存在很大差异。