拟黑多刺蚁雌激素相关受体基因cDNA的克隆及生物信息学分析

雌激素相关受体（estrogenrelatedreceptors,ERRs）能够直接与类固醇激素受体共激活子（steroidhormonereceptorcoactivator，SRC）结合，激活靶基因的表达，与众多生理和发育过程有关.采用RT-PCR、RACE等方法从拟黑多刺蚁PolyrhachisvicinaRoger克隆得到了雌激素相关受体基因的cDNA克隆，命名为pvERR（GenBank登录号为EF474463），并采用生物信息学方法对其cDNA和编码的蛋白质的理化性质、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行了预测和推断.结果表明：pvERR基因cDNA全长1935bp，包含一个1305bp的开放阅读框、245bp的5′-UTR和385bp的3′-UTR，编码一个由434个氨基酸组成的蛋白质.pvERR的配体结合区（ligandbindingdomain，LBD）主要由两个β折叠和11个α螺旋（H1,H3～H12,缺少H2）构成，这与哺乳类动物已知晶体结构的ERRγ的配体结合区结构非常相似.pvERR氨基酸序列与其他昆虫ERRs氨基酸序列同源性很高，它与西方蜜蜂Apismellifera雌激素相关受体amERR氨基酸序列相似性达到89.9%；在进化关系上，pvERR与人类HomosapiensERRs的关系比果蝇Drosophilamelanogaster雌激素相关受体dERR与人类的更近.本文可为进一步研究pvERR在昆虫发育中的功能提供有价值的信息.