|
昆虫学报 2012
以雾灵山夜蛾科为材料评估进化模型对DNA条码分类的影响, PP. 1193-1204 Keywords: 鳞翅目,夜蛾科,COI基因,进化模型,DNA条形码,系统发育树,物种鉴定 Abstract: 为了探究进化模型对DNA条形码分类的影响,本研究以雾灵山夜蛾科44个种的标本为材料,获得COI基因序列。使用邻接法(neighbor-joining)、最大简约法(maximumparsimony)、最大似然法(maximumlikelihood)以及贝叶斯法(Bayesianinference)构建系统发育树,并且对邻接法的12种模型、最大似然法的7种模型、贝叶斯法的2种模型进行模型成功率的评估。结果表明,邻接法的12种模型成功率相差不大,较稳定;最大似然法及贝叶斯法的不同模型成功率存在明显差异,不稳定;最大简约法不基于模型,成功率比较稳定。邻接法及最大似然法共有6种相同的模型,这6种模型在不同的方法中成功率存在差异。此外,分子数据中存在单个物种仅有一条序列的情况,显著降低了模型成功率,表明在DNA条形码研究中,每个物种需要有多个样本。
|