基于转录组数据高通量发掘扶桑绵粉蚧微卫星引物

【目的】扶桑绵粉蚧PhenacoccussolenopsisTinsley是我国重要的检疫性害虫。简单重复序列(simplesequencerepeat，SSR)研究在遗传图谱和物理图谱的构建、分子标记辅助育种、品种鉴定、基因定位、遗传多样性、动植物分类和进化等方面具有重要意义。筛选的SSR引物将为扶桑绵粉蚧遗传多样性分析、进化分析及入侵生物学等奠定基础。【方法】利用高通量搜索的方法对扶桑绵粉蚧转录组中28120条unigenes的数据进行搜索。【结果】共找到1781个SSR位点。扶桑绵粉蚧转录组中SSRs的主要重复类型是单核苷酸重复，占SSR总数的89.44%；其次是三核苷酸重复，占SSR总数的7.52%。单核苷酸重复里主要是A/T基序，占了总量的87.42%。基于筛选的SSRs，运用Primer3软件进行引物的批量设计，共有481个unigenes成功设计引物，共设计出1228对引物。【结论】研究表明利用扶桑绵粉蚧转录组数据开发SSR标记是可行的，本研究开发的引物将为扶桑绵粉蚧遗传多样性分析、进化分析及入侵生物学等奠定基础。