SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征
DOI: 10.13346/j.mycosystema.120294, PP. 280-288
Keywords: 黑木耳,毛木耳,转录组,简单重复序列,基序
Abstract:
以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSRLocator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰度和密度较黑木耳小。在两者的SSR中,三碱基和六碱基重复的出现最多。对含量最多的三碱基重复序列的基序进行分析表明富含GC的SSR在这两个种的转录组中占优势地位。
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