多核环境下的分子动力学模拟

本文在多核环境下，使用OpenMP实现了经典分子动力学模拟程序的并行；同时对分子动力学模拟进行了两项主要的优化：分子排序及运用SIMD指令运算。在4核下获得了4.13倍的计算性能提升，将经典分子动力学模拟的模拟规模提高至4000分子×107模拟总步数。