40株新城疫病毒全基因组的比较研究

？？？？利用作者单位测得的和从GenBank检索得到的40株新城疫病毒(NDV)全基因组序列,采用SMS、DNAStar等生物信息分析软件,比较分析NDV全基因组的基本特征和分子进化规律。结果表明:40株NDV全基因组核酸序列长度有3种:15？？186、15？？192、15？？198nt,均符合6倍数规律;基因组？A+T？含量占53％～54％,？C+G？含量占46％左右;NDV基因组前三分之一(4？？500nt前)序列存在高？GC？含量区,特别是在大约1？？200～2？？400nt区域,？GC？含量最高达到69％;？F？基因片段构建的分子进化树显示,40株NDV划分为两大类(ClassⅠ,ClassⅡ),基因组长度为15.198nt的毒株属于ClassⅠ,其余的属于ClassⅡ;ClassⅡ毒株又分为基因Ⅰ~Ⅶ型,这些已测序的毒株中没有基因Ⅷ和Ⅸ型;病毒6个基因CD-S序列构建的进化树显示,各基因进化基本保持一致,仅少数毒株存在差异,可能与病毒分子的基因重组有关。？