辣椒疫霉EST2SSRs标记的发掘

？？？？通过对GenBank上发布的55848条辣椒疫霉EST的鉴定,在328条EST中发现331个SSR。在筛选的EST序列中SSR平均密度为每2317kb含有1个SSR。在鉴定的SSR中,三核苷酸重复基元的SSR类型最多,占鉴定总数的5915%;其次为二核苷酸重复基元的SSR类型,为3913%;四核苷酸重复基元的SSR类型最少,为112%。设计40对SSR引物对5个辣椒疫霉菌株基因组DNA进行PCR扩增,有27对引物扩增出SSR特征条带,其中有18对引物在5个辣椒疫霉菌株间扩增出多态性条带25条。基于SSR标记进行聚类分析,可将5个检测大豆疫霉菌菌株划分为3类。该研究是辣椒疫霉的SSR标记开发的首次报道,为辣椒疫霉的遗传变异和分子作图等分析提供了一种有效的分子标记系统。