一个水稻小粒矮突变体的候选基因分析

？？？？通过T2DNA标签法,从水稻小粒矮突变体(sgd)的侧翼序列分析中,发现了一个与小泡膜蛋白(vesicle2associatedmembraneprotein,VAMP)形成相关的预测基因,该基因位于水稻第7染色体上编号为P0567H04的BAC中(基因座为Os07g37270),属于SNARE基因家族成员。RT2PCR分析结果显示,在小粒矮突变体与对照中花11之间.该候选基因叶、幼穗中存在显著的表达差异:突变体小粒矮的叶、幼穗的cDNA用ActinI引物标定浓度后,用该基因特异RT2PCR引物不能扩增出条带,而中花11的叶、幼穗的cDNA用RT2PCR引物则能扩增出条带,表明这个与小泡膜蛋白形成相关的预测基因(Os07g37270)是一个可表达的、有功能的基因,T2DNA插入目标位点后,可能造成了该基因的失活,因而产生了突变表型。性状调查结果显示,sgd突变体的结实率明显降低,植株变矮。以上结果说明,Os07g37270的功能与细胞中小泡膜蛋白的形成以及花粉的育性有关,推测其可能是控制小粒矮性状产生的候选基因。暂将该基因命名为OsVAMP,并进一步预测了该候选基因的进化信息。