猪LBP基因电子克隆及生物信息学分析

？？？？利用电子克隆技术,以人脂多糖结合蛋白(？LBP？)基因(NM？_004139)为种子序列,克隆猪？LBP？基因。结果表明:所克隆的？LBP？基因开放阅读框长为1446bp,编码481个氨基酸。推导其氨基酸序列与人、小鼠、大鼠、牛、狗的相似性分别为74？2％、64？8％、63？2％、77？1％和74？6％。进化树分析显示,猪与牛？LBP？基因进化距离最近,与大鼠最远。生物信息学分析表明,所克隆的猪LBP蛋白分子大小为53.0367ku,理论等电点为6？43;亚细胞定位预测猪LBP属于分泌蛋白,主要在线粒体(44？4％)和高尔基体(22？2％)中表达;N端存在信号肽,且在25～26位氨基酸可能存在裂解位点。N端的疏水性较强,且位于信号肽处,最大疏水性值为2？478,最大亲水性值为1？956;由胞外区(1～6位氨基酸)、跨膜区？(7～？29位氨基酸)和胞内区(30～481位氨基酸)3个部分组成的膜蛋白,有9个Ser、8个Thr和2个Tyr,可能成为蛋白激酶磷酸化的位点;LBP膜外区蛋白由多个？α？螺旋,膜内区由多个？β？折叠构成,？α螺旋和β？折叠平行交替排列,构成一个弯曲螺旋状结构;在33～256和271～474位氨基酸残基之间分别有1个BPI1和BPI2的保守结构域。