苏中某地区猪戊型肝炎病毒检测及基因序列分析

？？？？应用反转录-巢式聚合酶链法(RT-nPCR)对苏中某猪场猪粪便标本和生猪屠宰中心猪胆汁标本进行HEVRNA的检测,并对部分阳性标本进行克隆测序及阳性分析,以探讨猪戊型肝炎在该地区的流行特点。结果表明:采集的90份胆汁标本中,有4份HEV检测呈阳性,阳性率为4？44％。在140份猪粪便标本中,只有3～4月龄的35份标本中检出3份HEVRNA阳性,阳性率为8？57％。其余月龄粪便标本中均未检出HEVRNA阳性。序列分析发现猪HEV相互之间在ORF2部分区域的核苷酸序列的同源性为88？0％～100？0％。与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型的同源性为78？0%～86？0％,81？3％～82？7％,78？7％～84？0％,86？0％～98？7％。证明该地区存在猪戊肝病毒,且该猪源HEV属于基因Ⅳ型。