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中国科学 生命科学 2012
糜子miRNAs的生物信息学预测及实验验证, PP. 757-767 Keywords: microRNA,糜子,预测,验证,靶标 Abstract: microRNA是一类在转录后调控中发挥重要作用的非编码小RNA,其靶标参与高等植物的发育、代谢、胁迫应答等生物学过程.糜子是一类重要的禾谷类作物,但目前还未见与其相关的miRNA报道.通过基于表达序列标签和miRNA前体二级结构的同源搜索,鉴定到43个新的miRNAs.这些miRNAs不均匀地分布于11个miRNA家族.利用psRNAtarget对这些miRNAs分析表明,它们调控68个靶标基因.11个miRNAs家族中的10个参与了RNA调控,表明了它们在糜子转录后调控中的基本作用.利用Northernblot对8个家族的miRNAs进行了鉴定,表明本实验的预测方法是有效的.
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