大麦黄矮病毒GAV基因组全序列测定及其结构分析

测定了在中国分离得到由麦二叉蚜和麦长管蚜传播的大麦黄矮病毒GAV的基因组核苷酸全序列,该病毒分离物的RNA由5685个核苷酸组成,内含6个开放阅读框架(ORF)和4个非编码区(UTR),基因组大小和结构与黄症病毒属(Luteovirus)的大麦黄矮病毒PAV(BYDV-PAV)和MAV(BYDV-MAV)相似.序列分析表明,它与BYDV-MAV的PS1分离物基因组序列的同源性最高.在6个开放阅读框架中,除ORF6核苷酸序列同源性为72.0%外,其他ORF的核苷酸序列同源性均大于90%.两者全基因组的同源性为90.4%.推导的编码产物氨基酸序列同源性除P6和通读蛋白(RTP)分别为67.4%和87.4%外,其他均大于90%,其中外壳蛋白(CP)为95.5%.根据与BYDV-MAV的相似性,BYDV-GAV应是一种与BYDV-MAV类似的病毒.