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中国科学 生命科学 2006
花鲈(Lateolabraxjaponicus)VAMP-2基因的特征研究, PP. 334-339 Keywords: VAMP-2蛋白,SNARE蛋白,生物信息学分析,花鲈 Abstract: 应用反转录PCR和锚定PCR方法克隆了全长715个碱基的花鲈(Lateolabraxjaponicus)SPV2基因,证明其编码110个氨基酸的VAMP-2蛋白.运用生物信息学研究工具进行的一级结构分析显示:SPV2蛋白含有SNARE基序及其核心精氨酸残基,其序列N端有一N-糖肽键的糖基化位点,C端有一跨膜结构域.高级结构预测揭示SPV2蛋白的主要空间构象是一个组成SNARE基序的α螺旋卷曲骨架,其主要细节都与X晶体衍射方法得到的大鼠VAMP-2结构相一致.半定量PCR结果表明:在mRNA水平上,VAMP-2基因在鱼体各组织中广泛表达,其中以脑组织最为突出,而肌肉组织则相对最少.
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