基于细胞色素b基因片段序列研究中国近海石斑鱼类系统进化关系

石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学中的一个难题.为探讨中国近海石斑鱼类系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属28个种类的线粒体细胞色素b基因片段序列.采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2-parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,并结合GenBank上石斑鱼属的同源序列,以东洋鲈(Niphonspinosus)、真鲷(Pagrusmajor)等为外群构建NJ,MP,ML和ME系统树.从分子系统学的角度并结合形态学特征得出了如下结果:(i)鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化,是石斑鱼亚科中原始的类群;(ii)侧牙鲈属(Variola)与九棘鲈属(Cephalopholis)具有较近的亲缘关系;(iii)九棘鲈属是一个单系群,并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始;(iv)宽额鲈(Promicropslanceolatus)和驼背鲈(Cromileptesaltivelis)可以归入石斑鱼属;(v)石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支.