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应用昆虫学报 2013
昆虫质型多角体病毒同义密码子使用模式分析(重发)Keywords: 有效密码子数,enc-plot分析,中性绘图分析,对应分析,偏好性密码子 Abstract: 昆虫质型多角体病毒(cypovirus,cpv)是害虫种群重要调节因子,可用作生物防治剂。本研究采用多元统计分析方法对7种cpv进行密码子使用模式分析,结果表明:cpv密码子使用偏好性较弱,多数基因密码子使用模式受碱基组成影响,少数基因密码子使用模式除碱基组成外还有其它影响因素;中性绘图分析表明碱基组成主要受选择压力影响,受突变影响较小。同一电泳型cpv之间比同一宿主cpv之间共有的偏好性密码子多。cpv基因组内10个基因组片段之间密码子偏好性存在差异。cpv密码子偏好性与宿主昆虫密码子偏好性存在差异,所有cpv与其宿主昆虫共有的偏好性密码子均较少。对应分析进一步证明碱基组成是影响密码子使用的主要因素,不同电泳型cpv具有不同的密码子使用模式。聚类分析表明同一电泳型cpv密码子使用模式相似,同一宿主cpv密码子使用模式差异较大。
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